Por Trinidad Nacional tuvo poca eficacia y el partido terminó en contra 0-3. El partido por el tercer lugar se jugó en Yokohama contra el Club América de México, el juego terminó empatado 2-2 y Nacional logró la victoria desde el punto penal consiguiendo de esta manera el tercer lugar del torneo. Al final del año el club aportó seis jugadores al Once Ideal de América del diario El país de Uruguay, Reinaldo Rueda fue elegido como el Mejor Director Técnico del año y Miguel Borja como el Mejor jugador del año terminando, hasta ahora, la mejor temporada en toda la historia de Atlético Nacional. Debido al inesperado suceso, el día que se jugaría la final en el estadio Atanasio Girardot, el club, hinchas, Ejército Nacional, Alcaldía de Medellín, Gobernación de Antioquia y algunos asistentes de la ciudad de Chapecó rindieron un homenaje a las víctimas. Conmebol días después. En el plano futbolístico, Nacional fue el segundo equipo, en llegar a las dos finales más importantes de Sudamérica en una misma temporada, terminó invicto y con Miguel Borja como goleador del torneo, junto con el paraguayo Cecilio Domínguez, cada uno con 6 goles. En los cuartos de final el rival fue el club brasileño Coritiba, el partido de ida, jugado en Brasil, terminó 1-1 y la vuelta 3-1 con triplete del goleador Miguel Borja.
Al final de la fase de todos contra todos, Nacional terminó primero y enfrentó a Jaguares en los octavos de final, al cual derrotó 6-3 en el global. El partido de ida de la final, programado para el 30 de noviembre, nunca pudo ser jugado debido al accidente sufrido por el rival brasileño Chapecoense donde se perdió prácticamente todo el plantel. En el finalización, Nacional terminó tercero en la fase de todos contra todos; el los cuartos de final, enfrentó al Deportes Tolima y fue eliminado al empatar 2-2 en el global y caer 3-1 desde el punto penal. En este partido se presentó por primera vez el uso del árbitro asistente de video (VAR) para determinar una jugada dudosa, al cobrar un penal a favor del Kashima, que generó polémica en la prensa por el tiempo transcurrido antes de que el árbitro tomara la decisión. El rey Juan Carlos I dio la copa al capitán Carrete y el valencianismo celebró por todo lo alto este título tras varias temporadas mediocres. El 21 de junio fue presentado Juan Manuel Lillo como nuevo técnico de Nacional. ↑ a b Uribe, Juan Manuel (9 de marzo de 2011). «Orígenes de los clubes colombianos: Hoy Nacional (4)». Cápsulas de Fútbol.
↑ Pinilla Hurtado, Ramón Fernando (febrero de 2015). «El Fútbol de Ayer, Hoy y Mañana». ↑ a b Atlético Nacional: De la Nada a la Gloria, de Beatriz Eugenia Arango Mejía. Por su parte, Atlético Nacional solicitó a la Conmebol que el título le sea otorgado, de manera honorífica, al club brasileño. Posteriormente, el club fue galardonado con el Premio del Centenario Conmebol al Fair Play y con la Cruz y Medalla al Mérito Deportivo por la presidencia de Brasil. Sin su participación Brasil llegó a semifinales, siendo eliminada por los Países Bajos de Johan Cruyff. En 2017 el club inició su participación en el apertura dirigido por Reinaldo Rueda. Luego de la obtención de la Copa Libertadores, el club inició su participación en la Copa Sudamericana. El 14 de diciembre en Osaka, el club debutó en la Copa Mundial de Clubes contra el club japonés Kashima Antlers. El 19 de diciembre el argentino Jorge Almirón asumió la dirigencia de Atlético Nacional.
3 de diciembre Atlético Nacional hizo un homenaje a Chapecoense dedicando el triunfo derrotado con la nómina mixta 3-0 contra Millonarios, teniendo en cuenta que esta vez, igual que el torneo apertura, tuvo que competir con jugadores alternos, ya que el primer equipo disputaba la Copa Sudamericana y posteriormente, el Mundial de Clubes. Cuenta con un temporizador integrado que se apaga automáticamente después de 10 minutos. Sin embargo, ten en cuenta que los jugadores cambian de equipo y su popularidad puede variar. La serie fue iniciada en Brasil, cabe destacar que el plantel de Nacional fue recibido allí como héroe por su solidaridad mostrada al equipo brasileño luego de su incidente. Y cuando hubo dinero también se ganaban las Euroligas (Ros Valencia, Salamanca) eso sin cuando acaben los JJOO Todo será FUTBOL y como se peina CR7 o Leo. En las semifinales el rival fue Millonarios; el partido de ida, en Bogotá, terminó sin goles; el juego de vuelta llegó a los 90 minutos sin goles y Dayro Moreno aprovechó un rebote en el travesaño de Vikonis y marcó el gol de la clasificación a la final.